20221223【回放】-王东鹏丨DNA主动去甲基化促进细胞命运特化和DNA损伤响应
精选提问:
1.王老师您好,谢谢您的精彩报告!请问将TDG降解或者敲除后,enhancer区域累积的5hmC及5fC等如何影响基因的转录?
2.请问TLR4的增强子是怎么确定的呢?谢谢~
3.请问一下,这个现象是在神经元和免疫细胞中验证了,在肿瘤细胞会存在吗?
4.请问去掉TDG,会让细胞全基因组高甲基化,产生进一步的影响吗?
5.合子会发生全基因组去甲基化,是否也出现这种DNA损伤?
6.王老师您好我想问一下SAR-seq是怎么测出短补丁和长补丁的呢?长补丁的信号是会更强吗?看图上。
7.请问损伤位置为什么只发生在增强子的位置?
8.请问后半段有Tlr4 增强子例子,很好奇这个增强子是如何确定是Tlr4的增强子呢?是靠预测吗?还是通过Hi-C等手段确定的呢?谢谢~
9.请问一下是否有做过TDG的ChIP seq,来看TDG在DNA上的定位是否与检测到SSB信号重叠?
10.请问TDG可以识别单链5fC吗?
11.TDG也修复胞嘧啶脱氨,请问您如何排除脱氨的过程,而确定是TET去甲基化造成的呢?
12.UDG会修复胞嘧啶脱氨,TDG应该不会修复吧?
13.另外请问一下, araC的实验中,您用rH2AX来检测损伤,单链损伤是如何转变成双链损伤的呢?
14.请问下USER可以切DHU吗?
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演讲人介绍:
王东鹏:博士毕业于中国科学院生物物理研究所,师从陈润生院士。目前在美国国立卫生研究院癌症研究中心André Nussenzweig实验室从事博士后研究工作,研究方向为DNA损伤修复在神经元细胞命运决定及功能成熟中的作用及潜在应用,相关研究成果发表在Science, 并作为亮点文章被同期点评。
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